HLA-SuBiTo – Das Sequenziersystem
Um möglichst viele heterozygote Allelkombinationen im ersten Schritt zu trennen werden zur Reduzierung der Ambiguitäten zwei parallele Amplifikationen durchgeführt. Die Sequenzierung erfolgt durch 6 Sequenzierreaktionen pro HLA Klasse I Locus Sequenzierung und 2-3 Sequenzierreaktionen pro HLA Klasse II Locus Sequenzierung. Die Kombination aus Forward und Reverse Reaktionen erfolgt je nach positiver PCR-Amplifikation.
Gesamter Kitinhalt:
- Alle Komponenten für die Amplifikation inklusive der
Taq Polymerase - Exo-SAP-ITTM zur Reinigung der PCR-Produkte
- Genort- und exonspezifische Sequenziermixe inklusive BigDye® Chemie
-Prec-Buffer zur Fällung der Sequenzierprodukte- Second Stage Sequenziermixe für die Auflösung häufiger Ambiguitäten“
| Artikel Nr. |
Artikel |
Anzahl Typisierungen |
| 002 090 025 |
HLA-SuBiTo A high res Sequenzierung von Exon 2,3 und 4 |
25 |
| 002 091 025 |
HLA-SuBiTo B high res Sequenzierung von Exon 2,3 und 4 |
25 |
| 002 092 025 |
HLA-SuBiTo C high res Sequenzierung von Exon 2,3 und 4 |
25 |
| 002 093 025 |
HLA-SuBiTo DRB1 high res Sequenzierung von Exon 2 |
25 |
| 002 094 025 |
HLA-SuBiTo DQB1 high res Sequenzierung von Exon 2 und 3 |
25 |
| 002 095 025 |
HLA- SuBiTo DPB1 high res HLA- SuBiTo DPB1 high res |
25 |
| 002 090 0SW |
HLA-HiType Software Sequenzierungssoftware
für HLA-SuBiTo |
|
HLA-SuBiTo Second Level Sequenziermixe
Aufgrund der HLA-SuBiTo Strategie, mit zwei initialen PCR-Amplifikationen HLA-Allelgruppen zu trennen, sind die gängigen Cis/Trans Ambiguitäten im Vergleich zu Ein-Amplifikationsstrategien generell reduziert. Für den Fall, dass HLA-Allelgruppen nicht getrennt werden, können mögliche Ambiguitäten mit unseren gebrauchsfertigen Second-Level Sequenziermixen und dem bereits existierenden PCR-Produkt des Standardkits aufgelöst werden.
Klasse 1
| Artikel Nr. |
Artikel |
Tests |
| 002 290 001 |
HLA-SuBiTo Klasse I Seq2 No 1
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 9 (Forward) |
10 |
| 002 290 002 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 2
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 80 (Reverse) |
10 |
| 002 290 003 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 3
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 97 (Forward) |
10 |
| 002 290 004 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 4
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 114 (Forward)
Bereits im HLA-A Standardkit enthalten
|
10 |
| 002 290 005 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 5
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 156 (Reverse)
Bereits im HLA-A und –B Standardkit enthalten
|
10 |
| 002 290 006 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 6
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 163 (Reverse)
Bereits im HLA-B Standardkit enthalten
|
10 |
| 002 290 007 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 7
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 12 (Forward) |
10 |
| 002 290 008 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 8
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 24 (Forward) |
10 |
| 002 290 009 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 9
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 35 (Forward) |
10 |
| 002 290 010 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 10
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 66 (Forward)
Bereits im HLA-C Standardkit enthalten
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10 |
| 002 290 011 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 11
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 97 (Forward) |
10 |
| 002 290 012 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 12
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 114 (Forward) |
10 |
| 002 290 013 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 13
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 156 (Reverse) |
10 |
| 002 290 014 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 14
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 167 (Reverse) |
10 |
| 002 290 015 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 15
Auflösung von Ambiguitäten über Codon 171 (Reverse) |
10 |
| 002 290 016 |
HLA- SuBiTo Klasse I Seq2 No 16
Auflösung von Ambiguitäten über Intron 7 (Reverse)
Bereits im HLA-C Standardkit enthalten
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10 |